Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO2Q7Z6W1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO2Q7Z6W1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms