Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC4Q7Z404 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms