Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCQ7RTU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCQ7RTU9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms