Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SV2AQ7L0J3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms