Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP50Q70EL3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP50Q70EL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP50Q70EL3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
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