Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYDE1Q6ZW31 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms