Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R3FQ6ZSY5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R3FQ6ZSY5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms