Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXI2Q6ZQN5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXI2Q6ZQN5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms