Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFXL1Q6ZNB6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms