Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP6Q6ZN66 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP6Q6ZN66 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms