Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPOCD1Q6ZMY3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms