Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C12orf54Q6X4T0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C12orf54Q6X4T0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms