Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LRIG3Q6UXM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LRIG3Q6UXM1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms