Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO3Q6UWJ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCO3Q6UWJ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms