Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRSAM1Q6UWE0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRSAM1Q6UWE0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms