Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FIP1L1Q6UN15 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FIP1L1Q6UN15 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms