Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APOA5Q6Q788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOA5Q6Q788 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOA5Q6Q788 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms