Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC41PQ6P2S7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC41PQ6P2S7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms