Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LLGL2Q6P1M3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LLGL2Q6P1M3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms