Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAVIN1Q6NZI2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAVIN1Q6NZI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms