Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.372e-6■■□□□ 12
NIPBLQ6KC79 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.484e-6■■□□□ 12
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NIPBLQ6KC79 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.694e-12■■□□□ 12
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NIPBLQ6KC79 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 211.44□□□□□ -0.584e-9■■□□□ 11.8
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NIPBLQ6KC79 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-6■■□□□ 11.8
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NIPBLQ6KC79 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.38□□□□□ -2.032e-7■■□□□ 11.8
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