Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPPQ6IPU0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPPQ6IPU0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms