Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40Q6AI12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms