Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MALRD1Q5VYJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms