Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD4Q5VX71 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD4Q5VX71 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms