Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GKAP1Q5VSY0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GKAP1Q5VSY0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms