Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C10orf55Q5SWW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms