Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A3Q5K4L6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms