Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HABP4Q5JVS0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HABP4Q5JVS0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms