Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XKR4Q5GH76 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XKR4Q5GH76 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms