Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COBLL1Q53SF7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms