Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL22Q53GT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL22Q53GT1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms