Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM259Q4ZIN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM259Q4ZIN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms