Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GREB1Q4ZG55 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms