Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRY2Q49AN0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRY2Q49AN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms