Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TWISTNBQ3B726 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TWISTNBQ3B726 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms