Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MICAQ29983 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MICAQ29983 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MICAQ29983 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MICAQ29983 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MICAQ29983 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms