Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIDA1Q1XH10 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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