Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC142Q17RM4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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