Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HADHQ16836 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HADHQ16836 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHQ16836 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHQ16836 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HADHQ16836 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HADHQ16836 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HADHQ16836 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms