Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMA4Q16363 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMA4Q16363 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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