Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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