Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITSN1Q15811 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
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