Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALX1Q15699 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALX1Q15699 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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