Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF1AQ15573 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF1AQ15573 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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