Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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