Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPHARQ15513 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPHARQ15513 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms