Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TLR1Q15399 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TLR1Q15399 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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