Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SSPNQ14714 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSPNQ14714 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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