Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBI3Q14213 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EBI3Q14213 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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